为确保公司产品的品质质量，公司加大投入开展高产、高质制繁种技术研究，从基地选择、亲本保纯提纯、不育系育繁、高产制种、机械化、信息化等关键技术着手展开深入的技术研究，形成了一整套种子生产技术规范。近年来通过严格筛选优势基地，集中成片，加强监督与管理，提质提量。在湖南、海南、福建、江西、江苏等地稳定建立了16000余亩优势制种基地，年生产杂交种子能力达200万kg以上。2019年公司在全程机械化制种上取得了突破性进展，通过在德两优华占制种中实施父母本大行比种植、机械移栽、机械施肥、无人机喷施农药和“九二0”以及辅助授粉、父母本分收等机械化制种技术，亩产达253.6kg，进一步降低了制种成本，同时实现了制种高产高效的目标。
　　随着发展需求不断提高，金健种业投入400余万元对仓储及质检条件进行升级。公司现有5000余平方米高标准常温仓库和1100余平方米的低温冷库，拥有种子色选机、精选机等加工设备，建有先进的10T/h水稻种子自动化加工生产线及完备的质量检测体系，具备了一流的种子储藏、加工条件和全过程质量监控能力。同时，公司与中国水稻研究所、湖南省农科院等科研院所开展紧密合作、资源共享，拥有相配套的现代化分子检测设备。